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ここに記載されているものは一部の例となります。その他の解析にも柔軟に対応させて頂きますので、お気軽にご相談ください。



{yahoojp} {bits.cc}
項目概要主な納品物
Re-sequencing 配列決定技術の革新により可能となった一歩先の配列情報研究
Gap filling
/ 基本解析
・未完成のコンティグ配列を新規大量配列で拡張
・リードをアセンブル後、既存のドラフトコンティグにおける相対位置を探索
・完成度の高い配列セットを生成
・コンティグデータ
・ドラフト配列とコンティグの相対位置情報
Gap filling
/ 拡張解析
・既存の配列と新規配列によるScaffoldの構築
・コンティグ編集
・オプションでギャップフィリング用プライマ設計
・編集済みコンティグ配列
・Scaffold構造 【レヴォーグ コラゾン】レヴォーグ VMG/VM4 D型 フロントグリルtypeS FRP ヘキサゴンネット ストームグレー塗装済み、

、プライマ配列(オプション)
SNP
/ 多型基本解析
・リードのゲノム配列へのマッピング
・アライメントの構成
・変異位置と頻度の算出
・変異位置のリスト
・アライメント
・変異位置毎の頻度情報
SNP
/ 多型拡張解析
・マルチマップリード解析
・非マップリード解析
・遺伝子/SNPアノテーション
・ハプロタイプ解析やケースコントロール解析などの統計解析
・多型基本解析の情報拡張
・多型位置関係アノテーション
・ハプロタイプ情報
・統計解析結果
Digital expression DNAチップにかわる遺伝子発現解析!!遺伝子の絶対発現頻度情報を提供
Digital expression
/ 発現頻度基本解析
・リードを塩基配列データにマッピング(遺伝子リファレンス配列、全配列DB)
・マップ位置のアライメント構成と頻度計算
・発現プロファイル情報生成
・遺伝子上のリードのマップ情報
・遺伝子発現頻度情報
・発現プロファイル情報
Digital expression
/ 発現頻度拡張解析
・マルチマップリード解析
・非マップリード解析
・遺伝子アノテーション(遺伝子基本情報/モチーフ/GO/オルソログ)
・モデル生物を介した遺伝子アノテーション
・発現頻度基本解析の拡張情報
・遺伝子アノテーション情報
・モデル生物遺伝子アノテーション情報
Transcriptome 転写物の構造と翻訳産物の解析
Transcriptome
/ 転写物基本解析
・リードをゲノム+CDS配列にマッピング
・マップ位置のアライメント構成とエクソン単位の頻度計算
・ゲノム+CDS上のリードのマップ情報
・エクソン頻度情報
Transcriptome
/ 転写物拡張解析
・マルチマップリード解析
・非マップリード解析
・遺伝子アノテーション(遺伝子基本情報/モチーフ/GO/オルソログ)
・転写物構造情報の生成
・スプライシングバリアント解析
・転写物基本解析の情報拡張
・転写物アノテーション情報
・アイソフォーム頻度予測情報
de novo sequencing 次世代シーケンサーによるゲノム解読の高速化
de novo
/ 基本解析 A
・新規大量配列のみを用いたアセンブル
・オプションでアノテーション
・ドラフトコンティグデータ
・各種アノテーション(オプション)
de novo
/ 基本解析 B
・複数種類のシーケンサー由来のリードを用いたアセンブル
・キャピラリーシーケンサーから次世代シーケンサーまで、様々な種類のシーケンサーの組み合わせに対応
・ドラフトコンティグデータ
・各種アノテーション(オプション)
de novo
/ 拡張解析
・新規配列より、コンティグ作成、Scaffold構築
・オプションでゲノムアノテーション
・オプションでフィニッシング支援(プライマ設計など)
・塩基配列データ
・各種アノテーション(オプション)
・プライマ配列(オプション)
Gene Regulation 今、最も注目されている遺伝子制御手段
ChIP-Seq
/ 免疫沈降配列解析
・転写因子結合部位配列のゲノムへのマッピング、頻度解析
・多型拡張解析 [ホイール1本(単品)] SSR / EXECUTOR EX04 (FBK) 20インチ×9.0J PCD:112 穴数:5 インセット:21、発現頻度拡張解析、オプションでアノテーション
・リードのマップ情報
・頻度情報
・アノテーション(オプション)
Non Coding RNA解析 ・ncRNAのゲノムへのマッピング 16インチ サマータイヤ セット【メヴィウス(ZVW41N系)】WEDS レオニス FY パールブラックミラーカット 6.5Jx16RADAR Rivera Pro 2 205/60R16、頻度解析
・オプションでアノーテション
・リードのマップ情報
・頻度情報
・アノテーション(オプション)
Epi-genetics 次世代シーケンサーによるエピジェネティクス解析
メチレーション解析 ・リードのゲノムへのマッピング 、

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、methylation/notの頻度解析
・ターゲット間頻度解析
・オプションでアノテーションを追加
※検出系としてbisulfite法をサポート
・リードのマップ情報
・頻度情報
・アノテーション(オプション)
{yahoojp}jpprem01-zenjp40-wl-zd-11702